FFT計算中的第二個條件波形是重復(fù)的，更重要，也是一些混淆的根源。

考慮一個采集窗口（圖1中的左上角），其中正在查看的信號頻率是1 /采集窗口的倍數(shù)。這意味著我們在該窗口中有一個精確的整數(shù)周期，不僅如此，窗口開始時的電壓與窗口末端的電壓相同，這是一個真正重復(fù)的信號。在這種（理想的）情況下，頻譜信息非常純凈而沒有泄漏。當(dāng)執(zhí)行FFT時，可以得到單獨(dú)的正弦波分量。

現(xiàn)在，對相同頻率的信號，但采集窗口稍微改變，信號移位，這樣開始電壓和結(jié)束電壓將不同（圖1的右上角）。為了與FFT對信號重復(fù)的關(guān)鍵假設(shè)保持一致，我們補(bǔ)充窗口的數(shù)據(jù)，這樣做時，在一個窗口結(jié)束處的電壓與下一個窗口開始處的電壓之間產(chǎn)生不連續(xù)性。

所謂頻譜泄露，就是信號頻譜中各譜線之間相互干擾，使測量的結(jié)果偏離實(shí)際值，同時在真實(shí)譜線的兩側(cè)的其它頻率點(diǎn)上出現(xiàn)一些幅值較小的假譜。產(chǎn)生頻譜泄露的主要原因是采樣頻率和原始信號頻率不同步，造成周期的采樣信號的相位在始端和終端不連續(xù)。簡單來說就是因?yàn)橛嬎銠C(jī)的FFT 運(yùn)算能力有限，只能處理有限點(diǎn)數(shù)的FFT，所以在截取時域的周期信號時，沒有能夠截取整數(shù)倍的周期。信號分析時不可能取無限大的樣本。只要有截斷不同步就會有泄露。在圖1和圖2 中，為了最大化FFT 運(yùn)算之后的頻率分辨率，我們使用了矩形窗。圖中的時域信號是500MHz 正弦波信號，在頻譜上應(yīng)該僅在500MHz 頻點(diǎn)上看到譜線。FFT運(yùn)算研究的是整個時間域（-∞，+∞）與頻域的關(guān)系，所以對于矩形窗函數(shù)截取的波形應(yīng)該認(rèn)為是無窮延續(xù)的，因此，矩形窗100ns時間窗內(nèi)，包含了500MHz正弦波整50 個周期，所以波形的首尾能夠整周期得無縫連接，FFT 之后的頻譜會在500MHz 頻點(diǎn)看到較為純凈的能量值。

事實(shí)上，大多數(shù)類型的信號都不滿足上面的這種特殊情況，絕大多數(shù)信號在時間窗口內(nèi)都不是整周期的倍數(shù)，在這種情況下，FFT之后的頻譜就不能看做連續(xù)的正弦波了。例如，如果該正弦波的頻率是495MHz，在100ns 時間窗口內(nèi)包含49.5 個周期，因此在截取窗口的首尾部分就存在很大程度上的“不連續(xù)”，這種“不連續(xù)”會直接影響FFT之后的結(jié)果。“不連續(xù)”部分的能量會散落在整個頻譜范圍內(nèi)，使用100ns時間窗口，FFT之后的頻率分辨率是10MHz，495MHz 頻點(diǎn)即落在490MHz 與500MHz之間，所以495MHz正弦波信號的能量分成兩部分，所以從頻譜上看，峰值譜線明顯降低了，這被稱作是頻譜泄露（Leakage）。如下圖3所示：